1998年11月，陜西省高新技術產業投資有限公司經陜西省人民政府批準成立（陜政字[1998]82號），1999年9月正式揭牌；

1999年——2005年底，作為陜西省投資集團的全資子公司，遵照《陜西省重大科技產業化項目投資與管理辦法》，圍繞省科教領導小組確定的省重大科技產業化項目計劃開展投資業務。

2006年——2011年9月，按省政府決定，劃歸省國資委監管，主要完成開行政策性貸款項目、技改項目、陜南突破項目的投資及管理。2009年7月經省政府決定，將公司列為省科教領導小組的成員單位。

2011年10月至今，按省政府的決定，高投公司劃歸陜西金融控股集團有限公司管理，成為陜西金融控股集團有限公司全資子公司。